Questions/Réponses sur le logiciel Pixinsight.

On y traite des questions techniques de l'astrophotographie (Prises de vues, traitements, etc.)
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PierreLo
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Bien le bonjour,

Je propose un sujet questions/réponses sur Pixinsight dans lequel chacun peut poser sa question afin qu'une réponse lui soit apportée ou trouvée sur Internet.
On éditerait au fil du temps le 1er sujet pour historiser les questions et leurs réponses.

Qu'en pensez-vous ?

Je propose de commencer avec une problématique que j'ai rencontré et encore non résolue à ce jour.

Il s'agit d'un souci à la création du MasterDark.
Le message d'alerte de Pix :
No convergence in MRS noise evaluation routine.png
No convergence in MRS noise evaluation routine.png (25.75 Kio) Consulté 2222 fois
Récupéré sur WebAstro : http://www.webastro.net/forum/showthread.php?t=118104

Il semblerait que cela soit dû à certains darks qui parasitent l'ensemble, auriez-vous déjà rencontré ce souci ?
Savez-vous s'il est possible d'analyser chaque dark avec un script avant de créer le master ? (Je crois que c'est possible en utilisant un script présent dans ce sujet : http://pixinsight.com/forum/index.php?topic=3320.0 entre la 2ème et 3ème page)
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boulabytes
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Salut Pierre-Lo,

Pas sûr de pouvoir t'aider là dessus, mais dans le doute je te donne ma config...

En premier lieu, il faut configurer Pix pour qu'il ne débayerise pas automatiquement les images. Pour cela aller dans "Format explorer" (Ctrk +Alt +R), choisir dslr_raw et cliquer sur le bouton "Edit preferences".
Positionner les options cela :
dslr_raw_pref.png
dslr_raw_pref.png (64.52 Kio) Consulté 2210 fois
Ensuite je te donnes juste les process qui servent pour le master dark. Il faut retirer le signal de lecture de tes darks. On soustrait donc le masterbias à chaque dark :
Calib_Dark.png
Calib_Dark.png (66.44 Kio) Consulté 2210 fois
Ce process te crée autant de fichiers fits calibrés que tu avais de darks. C'est ensuite ces fichiers qu'il faut intégrer pour créer le master dark.
integration_dark.png
integration_dark.png (75.79 Kio) Consulté 2210 fois
J'imagine que tu fais déjà comme ça, mais dans le doute ... ;)

@++

Davy.
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boulabytes
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Autre question,

Quand tu lances l'integration du master dark ça échoue ou il te sort quand même une image ?

Je dis ça parce que, de mémoire, lors de l'intégration du master bias, j'avais des messages similaires, j'avais mis ça sur le compte du fait que l'intégration était réalisée sur des images bayerisées et que ça faussait son évaluation du rapport signal sur bruit.
Cependant, les algos de rejet fonctionnaient malgré tout. Typiquement, il essaient de faire la différence entre le signal de lecture et le bruit de lecture par leur différence de nature ; le bruit est aléatoire alors que le signal est stochastique.

Voilou,

@++

Davy.
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PierreLo
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boulabytes a écrit : En premier lieu, il faut configurer Pix pour qu'il ne débayerise pas automatiquement les images. Pour cela aller dans "Format explorer" (Ctrk +Alt +R), choisir dslr_raw et cliquer sur le bouton "Edit preferences".
C'est une des 1ères configuration que j'ai faite dans Pix :mrgreen: Les images sont en "gray" quand je les ouvre. :)
Donc sur ce point on est bon.
boulabytes a écrit : Ensuite je te donnes juste les process qui servent pour le master dark. Il faut retirer le signal de lecture de tes darks. On soustrait donc le masterbias à chaque dark :
Je ne calibrais pas mes darks avec mon SuperBias/MasterBias ...
Je suis en train de tester en parallèle sur le PC de la maison et :
Calibration avec SuperBIAS : Pas de problème.
Génération du MasterDARK : Même message, cf. ci-dessous.
** Warning: No convergence in MRS noise evaluation routine - using K-sigma noise estimate.done
35 FITS keywords extracted
Scale factors : 1.00000
Zero offset : +0.000000e+000
Noise estimates : 7.0532e-004
Weight : 1.00000
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_01_c.fit
Reading FITS: 32-bit floating point, 1 channel(s), 4320x2868 pixels: done
Computing image statistics: done
35 FITS keywords extracted
35 FITS keywords extracted
MRS noise evaluation: *
<* abort *>


Je le laisse aller jusqu'au bout et je posterai le MasterDARK généré malgré tout.
Par contre une chose dont je ne suis pas sûr, faut-il débayerisé les darks avant ? (je ne crois pas mais bon!)

Le résultat est disponible ici :
boulabytes a écrit :Autre question,

Quand tu lances l'integration du master dark ça échoue ou il te sort quand même une image ?

Je dis ça parce que, de mémoire, lors de l'intégration du master bias, j'avais des messages similaires, j'avais mis ça sur le compte du fait que l'intégration était réalisée sur des images bayerisées et que ça faussait son évaluation du rapport signal sur bruit.
Cependant, les algos de rejet fonctionnaient malgré tout. Typiquement, il essaient de faire la différence entre le signal de lecture et le bruit de lecture par leur différence de nature ; le bruit est aléatoire alors que le signal est stochastique.

Voilou,

@++

Davy.
Je vais maintenant faire le test en débayerisant les darks afin de voir si le message d'évaluation du bruit presiste et signe ;)

Merci Davy pour tes éclaircissements ! ;)
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boulabytes
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Bon effectivement, il y a un problème dans le résultat, ton master dark ne contient que 3 ou 4 pixel... pas glop.
Au niveau du rejet (dans la console) c'était comment ?
Il se peut que les niveaux de rejet aient été trop restrictifs que l'algo rejette tout...

Il me semble que tu avais partagé des darks dans ton drive, je vais jetter un oeil.

@++

Davy.
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boulabytes
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Ah zut le lien que tu avais donné ne fonctionne plus...
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PierreLo
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Non le lien ne fonctionne plus car j'ai supprimé les fichiers, c'était fait en mode 3 Nikon et c'est une catastrophe à traiter, voir même impossible.

Le masterdark généré en ayant pris soins de débayerisé avant n'est pas plus engageant car une poignée de pixels apparait...
Je te copie colle les données des réjections.
Pour la version darks débayerisés :
Integration of 10 images:
Pixel combination ......... average
Output normalization ...... none
Weighting mode ............ don't care
Scale estimator ........... MAD
Pixel rejection ........... Winsorized sigma clipping
Rejection normalization ... none
Rejection clippings ....... low=yes high=yes
Rejection parameters ...... sigma_low=5.000 sigma_high=5.000

* Using 1941 concurrent pixel stack(s) = 1311.45 MB

* Integrating channel 1 of 3:
Integrating pixel rows: 0 -> 1940: done
Integrating pixel rows: 1941 -> 2867: done

Pixel rejection counts:
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_010_c.fit
1 : 29 0.000% ( 0 + 29 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_01_c.fit
2 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_02_c.fit
3 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_03_c.fit
4 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_04_c.fit
5 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_05_c.fit
6 : 23 0.000% ( 0 + 23 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_06_c.fit
7 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_07_c.fit
8 : 6 0.000% ( 0 + 6 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_08_c.fit
9 : 6 0.000% ( 0 + 6 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_09_c.fit
10 : 23 0.000% ( 0 + 23 = 0.000% + 0.000%)

Total : 87 0.000% ( 0 + 87 = 0.000% + 0.000%)

* Integrating channel 2 of 3:
Integrating pixel rows: 0 -> 1940: done
Integrating pixel rows: 1941 -> 2867: done

Pixel rejection counts:
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_010_c.fit
1 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_01_c.fit
2 : 3 0.000% ( 3 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_02_c.fit
3 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_03_c.fit
4 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_04_c.fit
5 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_05_c.fit
6 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_06_c.fit
7 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_07_c.fit
8 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_08_c.fit
9 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_09_c.fit
10 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)

Total : 3 0.000% ( 3 + 0 = 0.000% + 0.000%)

* Integrating channel 3 of 3:
Integrating pixel rows: 0 -> 1940: done
Integrating pixel rows: 1941 -> 2867: done

Pixel rejection counts:
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_010_c.fit
1 : 29 0.000% ( 0 + 29 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_01_c.fit
2 : 17 0.000% ( 0 + 17 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_02_c.fit
3 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_03_c.fit
4 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_04_c.fit
5 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_05_c.fit
6 : 46 0.000% ( 0 + 46 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_06_c.fit
7 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_07_c.fit
8 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_08_c.fit
9 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/debayer_DARK_09_c.fit
10 : 29 0.000% ( 0 + 29 = 0.000% + 0.000%)

Total : 121 0.000% ( 0 + 121 = 0.000% + 0.000%)

MRS noise evaluation: /
** Warning: No convergence in MRS noise evaluation routine - using K-sigma noise estimate.|
** Warning: No convergence in MRS noise evaluation routine - using K-sigma noise estimate.\
** Warning: No convergence in MRS noise evaluation routine - using K-sigma noise estimate.done
Computing noise scaling factors: done

Gaussian noise estimates : 7.1924e-005 1.0470e-002 1.0121e-004
Scale estimates : 3.8221e-005 3.7842e-007 2.9273e-005
Location estimates : 2.5389e-005 4.4256e-007 1.7094e-005
SNR estimates : 1.0034e+004 2.2986e+000 1.8767e+003
Reference noise reduction : 0.6256 0.0000 0.3310
Median noise reduction : 0.5587 0.0000 1.4737


Pour la version classique :
Integration of 10 images:
Pixel combination ......... average
Output normalization ...... none
Weighting mode ............ don't care
Scale estimator ........... MAD
Pixel rejection ........... Winsorized sigma clipping
Rejection normalization ... none
Rejection clippings ....... low=yes high=yes
Rejection parameters ...... sigma_low=5.000 sigma_high=5.000

* Using 1941 concurrent pixel stack(s) = 1311.45 MB
Integrating pixel rows: 0 -> 1940: done
Integrating pixel rows: 1941 -> 2867: done

Pixel rejection counts:
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_010_c.fit
1 : 5 0.000% ( 0 + 5 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_01_c.fit
2 : 2 0.000% ( 1 + 1 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_02_c.fit
3 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_03_c.fit
4 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_04_c.fit
5 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_05_c.fit
6 : 5 0.000% ( 0 + 5 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_06_c.fit
7 : 0 0.000% ( 0 + 0 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_07_c.fit
8 : 1 0.000% ( 0 + 1 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_08_c.fit
9 : 1 0.000% ( 0 + 1 = 0.000% + 0.000%)
E:/Astrophotographie/CIEL PROFOND/M27/15082014/DARK_09_c.fit
10 : 4 0.000% ( 0 + 4 = 0.000% + 0.000%)

Total : 18 0.000% ( 1 + 17 = 0.000% + 0.000%)

MRS noise evaluation: \
** Warning: No convergence in MRS noise evaluation routine - using K-sigma noise estimate.done
Computing noise scaling factors: done

Gaussian noise estimates : 1.6600e-004
Scale estimates : 8.2285e-005
Location estimates : 1.1073e-004
SNR estimates : 6.0096e+004
Reference noise reduction : 0.2348
Median noise reduction : 13.1927
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boulabytes
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Je me souviens bien maintenant et je suis quasi sûr que j'avais ce message tout le temps. Mais malgré tout, le dark était exploitable.
** Warning: No convergence in MRS noise evaluation routine - using K-sigma noise estimate.done
Le message est un juste un warning, il n'arrive pas à évaluer le bruit avec sa méthode standard du coup il switche sur la methode k-sigma et la routine se termine (done) .
Donc pour moi le problème se situe ailleurs.
Car même si certains darks venaient polluer le calcul, ils rajouteraient du bruit. Au contraire, là, on un dark dépourvu de toute donnée, signal comme bruit.

Les paramètres à toucher, sont les suivants :
dark_integration_rejection.png
dark_integration_rejection.png (60.25 Kio) Consulté 2204 fois
Baisse le sigma low et le sigma high à 0. Comme ça il ne va rien rejeter.
Ce ne sera pas un bon master dark mais on verra si le problème vient de là.
Ensuite, on s'occupera de trouver les bonnes valeurs ;)

@++

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Et pis à l'occase si tu peux me mettre quelques darks à disposition :D (pas besoins de beaucoup pour faire des essais)

;)

++
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Et bien là je fais joujoue avec 10 darks qui sont ceux pour M27, je vais les mettre sur mon drive :)

Avec les valeurs sigma à zéro, le résultat est identique :( 100% identique, aussi peu de pixels...
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